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DTC基因檢測錯誤率達40%,行業(yè)規(guī)范勢在必行

   日期:2018-03-28     瀏覽:134    
核心提示:發(fā)布日期:2018-03-28   近年來,人們對遺傳學和個性化醫(yī)療的興趣日益增加,對直接面

發(fā)布日期:2018-03-28

 

 

  近年來,人們對遺傳學和個性化醫(yī)療的興趣日益增加,對直接面向消費者(DTC)基因檢測的需求也不斷上升,23andMe、Ancestry.com、Family Tree DNA等基因檢測公司也在為用戶提供相關(guān)服務。

  與臨床基因檢測不同,DTC基因檢測不具有診斷意義,僅為用戶提供遺傳風險信息。但一些DTC公司仍會給客戶提供原始基因分型數(shù)據(jù)和免責聲明,因為如果用戶的DTC基因檢測結(jié)果顯示他們攜有與某種疾病相關(guān)的基因變體,醫(yī)生有可能會根據(jù)這一檢測結(jié)果要求用戶進行進行額外的基因檢測和其他檢查。

  早在2009年,英國人類遺傳學委員會就發(fā)布了一套直接面向消費者基因檢測的原則辦法,旨在為消費者提供正確指導,并引導提供DTC基因檢測的公司提高檢測標準和結(jié)果一致性,建議在用戶進行檢測之前和之后提供相應的咨詢服務,并考慮用戶私隱問題,維護所有對DTC基因檢測感興趣的消費者權(quán)益。

  2017年4與,美國FDA已經(jīng)為23andMe的10份遺傳健康風險報告進行上市前授權(quán)。2018年3月6日,F(xiàn)DA批準了全球首個直接面向消費者的癌癥基因檢測產(chǎn)品上市申請,該產(chǎn)品被允許在沒有醫(yī)生處方的情況下,向用戶提供3個特定BRCA突變的基因檢測,這些特定基因突變與乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌的高風險相關(guān)。這一舉動也使23andMe成為首個獲得FDA批準進行癌癥風險篩查的消費級基因檢測公司。

  盡管各方都在為DTC基因檢測的進一步上市做出各種努力,但人們對于DTC基因檢測的準確性仍存有疑慮,雖然檢測結(jié)果可能會在用戶的生活方式、飲食方面產(chǎn)生積極健康影響,但同時也可能導致不必要的負面情緒,例如當DTC檢測缺乏全面分析或不準確時,意外結(jié)果會給用戶帶來不必要的失望與焦慮。

  近日,來自Ambry Genetics的研究人員對DTC檢測結(jié)果進行了準確度分析,發(fā)現(xiàn)目前DTC的原始數(shù)據(jù)報告約40%是錯誤的,轉(zhuǎn)介給他們進行確認檢測的每五個樣品中有兩個是假陽性。該結(jié)果已在Genetics in Medicine上發(fā)表。

  該文章的第一作者、Ambry遺傳咨詢師Stephany Leigh Tandy-Connor在一份聲明中表示,在這項特定研究中,假陽性率如此之高是我們沒有意料到的,這使我們對目前DTC基因檢測的準確性感到擔憂。

  對于這一出乎意料的分析結(jié)果,Ambry研究人員甚至查詢了他們的內(nèi)部數(shù)據(jù)庫,以確認那些在DTC基因檢測后轉(zhuǎn)介給他們的病人,發(fā)現(xiàn)在2014至2017年共有49例接受確認檢測的病例,并且多數(shù)為癌癥基因檢測。這其中一半以上的病例是通過診所申請等轉(zhuǎn)介給Ambry,而略高于25%的案例來自DTC的原始數(shù)據(jù)報告,其余的則來自第三方基因檢測服務。

  研究人員表示,Ambry的測試依賴于Sanger測序和NGS測序,DTC公司多采用一系列檢測方法。Ambry在驗證基因檢測分析證實了60%的DTC基因檢測結(jié)果,但其余的均為假陽性。驗證實驗中,所有CFTR和MEFV變異(分別與囊性纖維化和家族性地中海熱相關(guān))均得到驗證,而BRCA變異的驗證結(jié)果與種族相關(guān)。

 

圖:臨床基因檢測中的假陽性變體

  研究人員報告說,94.1%假陽性結(jié)果都與癌癥基因相關(guān)。其中一些是由于基因變體在原始數(shù)據(jù)或第三方口譯服務中被錯誤分類。例如,研究人員指出,五種基因變異(ATM、BRCA1、BRCA2、COL3A1、COL5A1 )被認為會增加最初的基因檢測風險,但Ambry和其他臨床實驗室認為其中一些變異是良性的,并且這些變異在普通人群中存在的水平很高,無法將它們與疾病聯(lián)系起來。

  Tandy-Connor指出,該研究結(jié)果突出了對DTC基因檢測結(jié)果進行驗證確認的必要性。雖然該研究規(guī)模很小,參與者不到50人,但這可能是因為大多數(shù)人不會尋求驗證性基因檢測。人們可能會認為DTC為他們提供了準確的醫(yī)療級別基因檢測,所以不會再為確認檢測結(jié)果付費。

  盡管驗證結(jié)果不甚理想,但仍有部分DTC基因檢測給人希望,如23andMe首席執(zhí)行官兼聯(lián)合創(chuàng)始人Anne Wojcicki稱,公司提供的DTC基因檢測結(jié)果與Sanger 測序的一致性超過99%,并通過研究證明,重復性和可重復性大于99%,具有極高的準確性和精確性,并能保證安全性和有效性。同樣根據(jù)Tandy-Connor所指出的,為確保準確性,該基因檢測結(jié)果的驗證仍需進行。

  FDA專員Scott Gottlieb也表示,F(xiàn)DA對于授權(quán)DTC基因健康風險檢測的策略可能鼓勵更多的實驗室進行DTC基因檢測的研發(fā)。希望隨著基因技術(shù)的發(fā)展,未來DTC基因檢測的準確性能夠有大幅提升,為那些缺乏疾病家族史、臨床基因檢測無法進行或者成本過高、保險覆蓋率低等原因而無法進行基因檢測的人們提供一種便利的基因檢測方式。

  政策規(guī)范可以為消費者提供正確指導,引導DTC基因檢測公司提高檢測標準和結(jié)果一致性,因此國內(nèi)外基因檢測行業(yè)規(guī)范勢在必行,而面對目前國外已經(jīng)出現(xiàn)的各種問題,國內(nèi)相關(guān)研究可以從中借鑒經(jīng)驗,進而避免走重復的彎路。

 

來源:測序中國

 
 
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